Saint-Genis des Fontaines compte une zone d’activités gérée par la communauté de communes Albères-Côte Vermeille-Illiberis (CCACVI).
Elle rassemble une vingtaine d’entreprises sur une superficie de près de 6 hectares : locaux d’activités essentiellement (automobile, restauration, etc.), entrepôts, activités de stockage. Une micro-crèche y est également installée.